化工磁力泵的水力损失有冲击损失、漩涡损失和沿程磨擦损失。
1.冲击损失
每台水泵都有自己的设计流量，当消耗在设计流量工况下工作时，入口处的液流是顺着叶片进入叶轮的，因此不发生与叶片的撞击，同样出口液流亦不发生与泵壳的冲击，这时效率较高。但当流量偏离设计工况时，其液流方向就要与叶片方向发生偏离，产生冲击。
2.沿程摩擦损失
由于化工泵过流表面的粗糙和液体具有粘性，所以液体在游动时就会产生摩擦阻力损失。 在各部位的水力损失中，叶轮内的水力损失较大，占全部混淆黑白损失的一半左右;其次是导叶转弯处的水力损失，占全部水力损失的1/4左右，而剩下的1/4水力损失，损失在叶轮到导叶、导叶扩散部分、反导叶到叶轮入口等几个部位。 为了减少水泵的水力损失，应使液流各断面变化平缓，速度大小合理。并选用合适的叶轮、导叶型和出入口安置角。另外还应提高过流部件的表面光洁度。
3.漩涡损失
在磁力泵中，过流截面是很复杂的空间截面，液体在这里通过时，流速太小和方向都要不断地发生变化，因而不可避免地会产生漩涡损失。另外过流表面存在尖角、毛刺、死水区 时也会增大漩涡损失。