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各地方政府为鼓励这两种方式的出口，相继出台了相应补贴政策，可咨询当地商务局相关补贴政策），在做退税申报前必须注意的一点是取得的进项上面的商品名称，商品单位必须与报关单上的保持一致，至于商品数量可以比报关单上少或者多（如果供应商很合作的话，可以要求供应商按照报关单的内容去，这样一一对应，可减少退税工作量）。
经保税区出口的货物，即报关单上的运输方式显示“非保税区”，有两种业务模式：
一是销售给境外但按客户要求运入保税区仓储后离境；
二是直接出口货物，但需要进保税区拼箱。
这两类经保税区出口的货物在申报出口退税时，新金税三期申报系统中必须要在明细申报表中的“业务类型代码”栏勾选BSQ，否则无法申报。
出口企业在申报运输方式显示“非保税区”报关的退税时，会有疑点提示，提示税务机关审核出境备案清单内容及企业填写的出口日期是否准确。其中这个出口日期，由于24号公告中对这类货物的退税率等是以备案清单的出口日期来判断，因此，出口退税申报系统中要求申报的出口日期是以出境备案清单显示的出口日期来填写。
第三步，海关工作人员审核、查验，这一步是必须要经历的，这里是刚才递交的报关材料，当然，在人工审核之前，必须要经历电子审核程序，如果一切没有问题，在审核之后会旅行；若是材料有漏洞或是材料没有准备齐全，那就要重新来一次了。人工审核差不多，只是审验起来比较麻烦，需要注意的是，如果货物超过当地海关的关税起征点，还需支付对应的关税哦。
